2月9日-10日,由海南大学、三亚崖州湾科技城主办的第一届热带植物国际学术会议在三亚崖州湾科技城举行。会议期间,海南大学-贝纳基因等千种热带植物基因组计划与热带作物基因组与分子育种数据库联合平台计划启动,将进一步加强热带海量植物资源保护与利用基础研究,服务海南热带高效农业发展,同时为热带雨林植物数字化管理提供理论依据及全新方法。

海南大学-贝纳基因等千种热带植物基因组计划启动。记者符彩云摄

千种热带植物基因组计划由海南大学牵头,国家热带雨林公园、中国农业科学院农业基因组研究所、浙江大学海南研究院、中国热带农业科学院等参加,与贝纳基因科技有限公司联合开展。热带作物基因组与分子育种数据库联合平台计划由海南大学与中国科学院北京基因组研究所国家基因组数据中心联合创建热带作物基因组与分子育种数据库平台。利用国家基因组开放平台和海南大学的人力资源和技术优势,通过长期数据积累和软件优化,提供服务功能强大而专业的热带作物(植物)基因组与分子育种数据库平台,服务全球热带生物基础研究和高效农业。

据了解,我国和全球热带植物物种遗传资源极为丰富,其经济价值和生态价值巨大。然而全球性热带经济植物的基础研究比较落后,除了少数热带经济作物完成基因组测序,绝大多数具有极高遗传多样性的热带雨林植物、珍稀濒危植物的基因组知识了解甚少,而这些基础数据的获取不仅是开展遗传改良所必需,同时也是进化分类关系重建,遗传多样性定量评估,制定合理保护策略的基础。

另一方面,随着第三代基因组测序技术的长足进步,使得一般基因组测序与组装能力大大提升,成本显著减低。通过海南大学与贝纳基因的长期合作,制定最佳的基因组测序-组装作业策略,能够快速、高效完成大量基因组测序和数据处理工作,陆续发表高质量基因组,淀积数据,支持遗传改良和大尺度生物演化的研究。相关研究将服务海南省热带高效农业发展,同时为热带雨林国家果园建设提供最基础和极为重要的科学数据。

热带作物基因组与分子育种数据库联合平台计划启动。记者符彩云摄

海南热带珍稀濒危植物及特有种是热带雨林保护物种的重中之重,有许多具有重要的科学价值和经济价值。近20年来,有关热带珍稀濒危植物的生存现状缺乏进一步跟踪调查,对于珍稀濒危植物无长期定位监测。通过基因组学结合多组学数据开发,能够为热带雨林植物的遗传多样性及其分类关系进行合理规划,获取大数据信息,利用基础信息集合地理信息就可以建立一套雨林植物监测和管理的平台,提升国家公园管理水平及科普价值。

海南大学热带作物学院、海南大学三亚南繁研究院比较基因组与系统生物学方向负责人王文泉介绍,“我们需要把现有的大量的数据资源进行收集整合,然后对其机构化,创建千种热带植物基因组及遗传多样性数据库。数据库建成后,不仅能对本土热带雨林植物实施更加科学和合理的保育及可持续利用,还将极大提高品种选育的速度和效率,促进热带作物育种技术进步。”

据了解,计划启动后,海南大学及合作单位将完成1000种热带特色经济植物基因组测序注释,涵盖热带特有植物、珍稀濒危植物、热带特色水果、蔬菜、药用植物、观赏植物、油料、经济林木和具有特殊生态价值物种;并结合图像信息,构建海南热带雨林国家公园数字化管理系统。

(记者符彩云)